豬瘟藍耳口蹄疫CSFV/PRRSV-U/FMDV-U熒光PCR說明書
【產(chǎn)品名稱】
商品名稱:豬瘟病毒/豬藍耳病病毒通用型/口蹄疫病毒通用型(CSFV/PRRSV-U/FMDV-U)核酸檢測試劑盒(實時熒光-PCR 法)
Name :Classical swine fever virus / swine ear disease virus universal / foot-and-mouth disease virus universal (CSFV/PRRSV-U/FMDV-U) nucleic acid detection kit (real-time fluorescence -PCR)
【包裝規(guī)格】48T/盒
【預期用途】
口蹄疫病毒(FMDV)屬小 RNA 病毒科屬,是小的動物病毒之一,在世界范圍廣泛分布,其中,O、A、C 型 FMDV 的毒力和抗原性均易發(fā)生變易,幾乎遍布亞、非、拉、歐各洲;AsiaⅠ型主要分布在亞洲;SATI、SAT2、SAT3 型主要分布在非洲[1-2]。口蹄疫病毒血清型復雜多變,為檢測帶來了較大的難度[3]。
本試劑盒適用于檢測口蹄疫易感動物的水泡皮及水泡液、O/P 液等標本中口蹄疫病毒通用型 RNA,適用于口蹄疫病毒通用型感染的輔助診斷。
【檢驗原理】
本試劑盒對口蹄疫病毒通用型特異核酸序列設計引物和探針,用一步法熒光RT-PCR 技術對口蹄疫病毒通用型 RNA 進行體外擴增檢測,用于臨床上對可疑感染者的病原學診斷。
【試劑組成】
名 稱 規(guī) 格
酶液 50μL×1 管
FMDV-U 反應液 1.0mL×1 管
FMDV-U 陽性質(zhì)控品 50μL ×1 管
陰性質(zhì)控品 250μL ×1 管
注:
1)不同批號試劑不能混用。
2)試劑盒內(nèi)各試劑組份足夠包裝規(guī)格所標示的檢測次數(shù)。
【儲存條件及有效期】
-20℃±5℃,避光保存、運輸、反復凍融次數(shù)不超過 5 次,有效期 12 個月。
【適用儀器】
ABI 、安捷倫 MX3000P/3005P、LightCycler、Bio-Rad、Eppendorf 等系列熒光定量 PCR 檢測儀。
【標本采集】
病死或撲殺動物,取水泡皮及水泡液;待檢活動物,取 O/P 液 2~3mL。
【保存和運輸】
上述標本短期內(nèi)可保存于-20℃,長期保存可置-70℃,但不能超過 6 個月,標本運送應采用 2~8℃冰袋運輸,嚴禁反復凍融。
【使用方法】
1.樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1樣本前處理
水泡皮樣品:稱取水泡皮 0.5g 于研磨器中研磨,加入生理鹽水繼續(xù)研磨,待勻漿后轉至 1.5mL 滅菌離心管中,8000rpm 離心 2min,取上清液 100μL 于 1.5mL 滅菌離心管中;OP 液或水泡液樣品,直接取 100μL 置于 1.5mL 滅菌離心管中。
1.2RNA 提取
推薦采用上海晅科生物科技有限公司生產(chǎn)的RNA 提取試劑盒(離心柱提取法),請按照試劑盒說明書進行操作。
2.試劑配制(試劑準備區(qū))
根據(jù)待檢測樣本總數(shù),設所需要的 PCR 反應管管數(shù)為 N(N=樣本數(shù)+1 管陰性對照+1 管陽性對照;樣品每滿 7 份,多配制 1 份),每測試反應體系配制如下表:
試劑 FMDV-U 反應液 酶液
用量 20μL 1μL
將混合好的測試反應液分裝到 PCR 反應管中,21uL/管。
3.加樣(樣本處理區(qū))
將步驟 1 提取的 RNA、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取 4μL,分別加入相應的反應管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4.PCR 擴增(核酸擴增區(qū))
4.1將待檢測反應管置于熒光定量 PCR 儀反應槽內(nèi);
4.2設置好通道、樣品信息,反應體系設置為 25μL;熒光通道選擇: 檢測通道
(Reporter Dye)FAM, 淬滅通道(Quencher Dye)NONE,ABI 系列儀器請勿選擇 ROX 參比熒光,選擇 None 即可。
4.3推薦循環(huán)參數(shù)設置:
步驟 循環(huán)數(shù) 溫度 時間 收集熒光信號
1 1 cycle 42℃ 20min 否
2 1 cycle 95℃ 10min 否
3 40 cycles 94℃ 15sec 否
55℃ 30sec 是
5.結果分析判定
5.1結果分析條件設定
設置 Baseline 和 Threshold:一般直接按機器自動分析的結果分析,當曲線出現(xiàn)整體傾斜時,根據(jù)分析后圖像調(diào)節(jié) Baseline 的start 值(一般可在 3~15 范圍內(nèi)調(diào)節(jié))、
stop 值(一般可在 5~20 范圍內(nèi)調(diào)節(jié)),以及 Threshold 的 Value 值(上下拖動閾值線至高于陰性對照),重新分析結果。
6.質(zhì)控標準
陰性質(zhì)控品:無明顯擴增曲線丏無 Ct 值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴增曲線有明顯指數(shù)生長期,丏 Ct 值≤32; 以上條件應同時滿足,否則實驗視為無效。
【參考文獻】
[1]Mulle JD,McEachern JA,Bossart KN,et al. Serotype-independent detection of foot-and-mouth disease virus [J]. J Virol Methods [J].2008,151(1):146-153.
[2]吳紹強.亞歐型及南非型口蹄疫一步法多重熒光 RT-PCR 檢測方法建立[J]. 中國農(nóng)業(yè)科學,2010,43(14):3019-3026.
[3]Mason PW,Grubman MJ,Baxt B. Molecular basis of pathogenesis of FMDV [J].Virus Res,2003,91(1):9-32.
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